Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A5P29400 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms