Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB2P29033 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB2P29033 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB2P29033 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB2P29033 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB2P29033 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB2P29033 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB2P29033 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB2P29033 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB2P29033 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms