Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GCAP28676 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GCAP28676 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GCAP28676 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GCAP28676 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GCAP28676 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GCAP28676 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GCAP28676 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms