Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLD1P28340 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLD1P28340 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLD1P28340 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
POLD1P28340 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLD1P28340 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD1P28340 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD1P28340 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms