Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms