Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms