Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1P23443 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms