Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDSP20132 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDSP20132 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDSP20132 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDSP20132 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDSP20132 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDSP20132 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDSP20132 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDSP20132 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDSP20132 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms