Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms