Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPI1P17947 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPI1P17947 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPI1P17947 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SPI1P17947 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPI1P17947 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPI1P17947 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPI1P17947 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPI1P17947 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms