Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166 ms