Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMPD1P17405 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms