Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GNB3P16520 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GNB3P16520 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB3P16520 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB3P16520 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms