Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB4P16144 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB4P16144 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms