Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG2P13521 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG2P13521 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG2P13521 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG2P13521 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG2P13521 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms