Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms