Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL11A1P12107 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms