Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHGAP10645 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHGAP10645 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHGAP10645 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHGAP10645 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHGAP10645 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHGAP10645 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms