Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB5P09067 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms