Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF1RP07333 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms