Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPBP07199 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPBP07199 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms