Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms