Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPLP1P05386 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms