Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTA1P02549 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPTA1P02549 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms