Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-7P01780 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-7P01780 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms