Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD3O95983 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD3O95983 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD3O95983 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MBD3O95983 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms