Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms