Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPINO95295 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms