Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms