Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms