Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms