Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCO2O43819 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCO2O43819 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCO2O43819 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCO2O43819 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCO2O43819 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCO2O43819 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms