Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms