Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 MATK-211ENST00000590980 562 ntTSL 412.69□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.215e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.225e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 ZC3H18-212ENST00000569435 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.92□□□□□ -0.345e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.575e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.75e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.835e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-205ENST00000638233 2046 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.95e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-220ENST00000640505 1852 ntTSL 59.04□□□□□ -0.965e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-208ENST00000638661 1796 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.975e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-209ENST00000638694 1614 ntTSL 58.86□□□□□ -0.995e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-213ENST00000639443 2727 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.065e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-211ENST00000639318 2009 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.065e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PLXNC1-211ENST00000551850 527 ntTSL 47.07□□□□□ -1.285e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-212ENST00000639364 3298 ntTSL 56.46□□□□□ -1.385e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 GLDC-218ENST00000639954 3279 ntTSL 55.87□□□□□ -1.475e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RNF31-203ENST00000491351 1804 ntTSL 520.04■□□□□ 0.81e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.171e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RNF31-224ENST00000560787 2834 ntTSL 210.37□□□□□ -0.751e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -11e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 TMEM198-203ENST00000421791 1057 ntTSL 216.46■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 FHL3-203ENST00000477194 1091 ntTSL 225.75■■□□□ 1.719e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.925e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 419.44■□□□□ 0.75e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 518.98■□□□□ 0.635e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.545e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.55e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RAB31-205ENST00000578734 783 ntTSL 318.15■□□□□ 0.55e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RAB31-210ENST00000581109 469 ntTSL 318.15■□□□□ 0.55e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.475e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RAB31-211ENST00000583137 714 ntTSL 317.87■□□□□ 0.455e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CNOT6-205ENST00000507016 382 ntTSL 317.67■□□□□ 0.425e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.429e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.315e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 OXR1-203ENST00000435082 2023 ntTSL 216.87■□□□□ 0.295e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 KLHL17-203ENST00000466300 913 ntTSL 316.58■□□□□ 0.241e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.234e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 416.19■□□□□ 0.186e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 P4HB-216ENST00000571617 505 ntTSL 316.07■□□□□ 0.164e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.165e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.155e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.155e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PGS1-211ENST00000589425 1944 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.155e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.151e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.115e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PGS1-209ENST00000588169 1700 ntTSL 215.7■□□□□ 0.15e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.67■□□□□ 0.16e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.095e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.084e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PGS1-212ENST00000589426 2033 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.075e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.045e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.025e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.025e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -05e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 SLC43A3-217ENST00000530005 1434 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.015e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PLK3-204ENST00000465443 2477 ntTSL 514.74□□□□□ -0.055e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CDC37-210ENST00000593124 1389 ntTSL 514.71□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 314.6□□□□□ -0.076e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 BABAM1-216ENST00000601436 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.46□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 BABAM1-207ENST00000596335 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.46□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MIIP-203ENST00000466860 1709 ntTSL 514.41□□□□□ -0.11e-9■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.115e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 FHL3-202ENST00000475084 882 ntTSL 514.3□□□□□ -0.129e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 P4HB-202ENST00000415593 1669 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.144e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.144e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.145e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.185e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.195e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.195e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.25e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CNOT6-203ENST00000502447 552 ntTSL 313.76□□□□□ -0.215e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PGS1-210ENST00000588281 1776 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.215e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.236e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MIIP-207ENST00000498685 1392 ntTSL 213.55□□□□□ -0.241e-9■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 FHL3-205ENST00000485803 1468 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.259e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CREB1-204ENST00000421139 713 ntTSL 513.5□□□□□ -0.255e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PGS1-213ENST00000589689 1168 ntTSL 213.48□□□□□ -0.255e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.255e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 AMPD2-216ENST00000527846 585 ntTSL 413.46□□□□□ -0.254e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 AMPD2-222ENST00000531203 575 ntTSL 413.24□□□□□ -0.294e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PHRF1-204ENST00000532550 748 ntTSL 313.22□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 AMPD2-217ENST00000528270 588 ntTSL 413.14□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.315e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 BABAM1-205ENST00000595393 1471 ntTSL 213.06□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.355e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 212.8□□□□□ -0.366e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 P4HB-208ENST00000473021 914 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.374e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 512.73□□□□□ -0.375e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 ECI2-208ENST00000478266 1133 ntTSL 512.66□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 AMPD2-223ENST00000531734 572 ntTSL 412.6□□□□□ -0.394e-6■■■■□ 21.3
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 157.3 ms