Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASKO14936 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASKO14936 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASKO14936 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASKO14936 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASKO14936 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASKO14936 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASKO14936 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASKO14936 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASKO14936 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASKO14936 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASKO14936 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASKO14936 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASKO14936 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms