Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLIM4O00461 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms