Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQV1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQV1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
H3BQV1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H3BQV1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H3BQV1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
H3BQV1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H3BQV1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQV1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQV1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQV1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQV1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQV1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQV1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQV1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQV1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQV1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQV1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQV1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQV1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms