Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E9PBE3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E9PBE3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E9PBE3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E9PBE3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E9PBE3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E9PBE3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms