Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLRF2D3W0D1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF2D3W0D1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms