Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf172C9J069 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf172C9J069 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms