Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVV-1B6SEH8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms