Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DEV8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B4DEV8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms