Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms