Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms