Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms