Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms