Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FRMD3A2A2Y4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms