Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.92-201ENST00000613789 329 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6511A3-201ENST00000615389 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6511A4-201ENST00000615860 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6511A1-201ENST00000617664 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DPCD-206ENST00000626968 541 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 151 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP36-206ENST00000639280 2685 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4A-202ENST00000368282 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP13-217ENST00000560302 3765 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RASSF6-203ENST00000342081 4331 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP3-205ENST00000391827 2940 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP25-202ENST00000409202 2945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ADIPOQ-202ENST00000444204 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CSGALNACT2-201ENST00000374466 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT3B-201ENST00000201963 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF561-201ENST00000302851 4693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SOCS4-204ENST00000555846 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL11A-202ENST00000356842 3959 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NUPR1-201ENST00000324873 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NFXL1-206ENST00000507489 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GK5-201ENST00000392993 9837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01104-202ENST00000452354 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH8-201ENST00000328405 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104825.2-201ENST00000505448 3249 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AP5S1-205ENST00000615891 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 THBS4-204ENST00000511733 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms