Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MAPK10-248ENST00000640490 2715 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MYH2-204ENST00000532183 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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