Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms